Le Fonds de développement de la recherche universitaire avait été conçu pour améliorer l’infrastructure de recherche dans les universités admissibles qui avaient reçu, pendant la période 1994-1996, moins de 1 p. 100 des fonds totaux de la recherche subventionnée dans les universités canadiennes. La FCI a investi 36 M$ dans ce fonds. Depuis 2001, les établissements qui y étaient admissibles peuvent soumettre des propositions au Fonds d’innovation.