Le Fonds de développement de la recherche dans les collèges avait été conçu pour aider les collèges, instituts et leurs centres de recherche affiliés canadiens à mettre en place et à renforcer leurs infrastructures de recherche dans les domaines indiqués dans leurs plans institutionnels de recherche. Les collèges pouvaient proposer des projets dont les coûts admissibles totalisaient jusqu’à 2 M$ avec une contribution maximale de 800 000 $ de la part de la FCI. La FCI a investi 15,6 M$ dans ce fonds. Depuis 2001, les établissements admissibles soumettent des propositions au Fonds d’innovation.